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附属九院精准医学研究院雷鸣团队揭示酵母中tRNA前体被核糖核酸酶P催化切割成熟的分子机制

国际权威学术期刊《科学》( Science)于9月28日以长文的形式在线发表了附属九院精准医学研究院雷鸣团队的最新研究成果“Structural insight into precursor tRNA processing by yeast ribonuclease P”,揭示了真核生物中tRNA前体5’端的加工成熟机制。

tRNA作为体内重要的一类RNA分子,它首先是以前体的形式被转录出来,具有未成熟的5’和3’末端,其中5’端的成熟需要在进化上十分保守的RNA-蛋白质复合物RNase P来催化完成。RNase P存在于地球上的所有物种中,是生命活动所必需的,是由RNA介导并负责tRNA前体催化反应的核酶。真核生物的RNase P 是由一条长链RNA分子(~300nt)和近十个蛋白质亚基组成的分子机器。目前我们对于真核生物中RNase P的组装形式以及其底物识别和催化机制还了解甚少。

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在本研究中,雷鸣团队成功解析了酵母内源RNase P 全酶及其与底物pre-tRNA的复合物结构,这个结构揭示了真核生物中RNase P各亚基在空间上原子分辨率的组织形式,各蛋白质亚基紧密交织在一起形成钩状结构来稳定住RNA催化亚基的构象。同时他们发现RNase P以一种“双锚定(double anchor)”的机制来识别tRNA前体。tRNA的5’端被特异的锚定在催化中心以促使其完成切割反应。底物tRNA的结合诱导了该酶催化中心一个关键残基的巨大的构象变化。最后结合分子动力学模拟,他们提出了RNase P 催化反应的双镁离子模型,深入阐释了这一类古老核酶的催化分子机制。这一里程碑式的研究工作首次完整的提出了真核生物RNase P催化底物tRNA前体切割成熟的分子机制,为核酶及RNA结构生物学领域的重大突破。

附属九院精准医学研究院兰鹏飞助理研究员、雷鸣课题组谭明博士以及中科院大连化物所副研究员张跃斌为该论文的共同第一作者;附属九院精准医学研究院雷鸣研究员、武健研究员以及中科院大连化物所李国辉研究员为该论文的共同通讯作者;上海交通大学医学院附属第九人民医院是第一单位;该研究受到国家自然基金项目以及中科院战略性先导项目(B类)资助。

论文链接:http://science.sciencemag.org/content/early/2018/09/26/science.aat6678?rss=1

汪利俊
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